|
|
|
|
Derleme Yazı Review Article |
SARS-Cov-2 ve Diğer
Koronavirusların Genomik ve Biyolojik Özellikleri Genomic and Biologic Characteristics
of SARS-CoV-2 and Other Coronaviruses Tuğrul
HOŞBUL1 [ID], *Fatih
ŞAHİNER1 [ID] Özet Koronaviruslar iyi tanımlanmış
insan ve hayvan patojenleri olup, insanlarda başlıca solunum yolu
enfeksiyonları ile ilişkilidirler. Sayıları 40’a yakın olan
koronavirus türlerinden
yedisi insan enfeksiyonları ile ilişkilidir. Bu virüslerden dördü (HCoV-229E, HCoV-NL63,
HCoV-OC43 ve HCoV-HKU1) mevsimsel enfeksiyonlara neden olan solunum yolları patojenleri iken, özellikle hastane salgınları ile karşımıza çıkan SARS-CoV ve MERS-CoV ise ciddi solunum
yolu enfeksiyonlarına neden
olan türler olarak ilk kez 2003 ve 2012 yıllarında
tanımlandı. SARS-CoV ile genomik benzerliği nedeniyle
Uluslararası Virüs Taksonomi Komitesi tarafından SARS-CoV-2 olarak adlandırılan yeni bir
tür 2019 yılı sonlarında Çin’den başlayarak 3 ay içerisinde tüm dünyaya yayıldı. Gelişmiş ülkelerde sağlık sistemlerinin çöküşü ve dünya genelinde neden olduğu yaygın endişe ile dikkatleri üzerine çeken bu salgın ile ilgili hala öngörülemeyen birçok nokta bulunmaktadır. Virüsün genetiği ve biyolojisi, neden olduğu enfeksiyonun klinik seyri ve
komplikasyonları, yeni aşı ve ilaç çalışmaları ve salgının boyutları ile ilgili literatüre yoğun bir şekilde her gün yeni bilgiler eklenmektedir. Bununla beraber virüsün
koronavirus ailesindeki diğer virüs türleri ile
paylaştığı birçok ortak özellik bulunmakta ve bunların bilinmesi
SARS-CoV-2 salgınının nereye doğru gideceğini, aşıların olası yararlılıklarını veya
mutasyon hızı gibi bilinmeyen ve endişelere neden
olan konuların daha kolay anlaşılmasında önem taşımaktadır. Bu makalede koronavirusların genel
biyolojik ve genetik özellikleri
ele alınarak bunlardan bazılarının SARS-CoV-2 ile karşılaştırmaları yapılmıştır. Anahtar kelimeler: Covid 19,
Pandemi, SARS-CoV, MERS-CoV. Abstract Coronaviruses are
well-defined human and animal pathogens and are primarily associated with
respiratory tract infections in humans. The number of coronavirus species is
close to 40 and seven of which are associated with human infections. While
four of these viruses (HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43 and HCoV-HKU1) are
respiratory pathogens that cause seasonal infections, SARS-CoV and MERS-CoV,
which are especially encountered with hospital outbreaks, cause severe acute
respiratory infections and discovered in 2003 and
2012, respectively. A new species named SARS-CoV-2 due to its genomic
similarity with SARS-CoV by the International Virus Taxonomy Committee spread
to all the countries of the world within 3 months starting from China at the
end of 2019. There are many unpredictable points regarding this epidemic,
which attracted attention due to the collapse of health systems in developed
countries and widespread concern in the world. New information is intensively
added to the literature on the genetics and biology of the virus, the
clinical course and complications of the infection, new vaccine and drug
studies, and the extent of the outbreak. However, there are many common
features that the virus shares with other types of viruses in the coronavirus
family, and knowing them is important for easier
understanding of unknown and anxious issues such as where the SARS-CoV-2
outbreak is going, the possible benefits of the vaccines, or the rate of
mutation. In this article, general biological and genetic characteristics of
coronaviruses are discussed and some of them are compared with SARS-CoV-2. Keywords: Covid 19, Pandemic, SARS-CoV, MERS-CoV.
Şekil 1. Koronavirusların konak çeşitliliği ve
konaklar arası yayılımı. Şekil 1 png Figure 1. Host diversity
of coronaviruses and ve spreading between hosts. Figure 1 png
Şekil 2. Koronavirus virion yapısı ve temel
proteinleri. Şekil 2 png Figure 2. Coronavirus
virion structure and viral proteins. Figure 2 png
Şekil 3. SARS-Cov-2 genomik yapısı (GenBank
MN908947) ve diğer koronaviruslarla benzerlik oranları. Şekil 3 png Figure 3. SARS-Cov-2
genomic structure (GenBank MN908947) and similarity rates with other
coronaviruses. Figure 3 png
Şekil 4. Koronaviruslarda hücresel replikasyon
döngüsü. Şekil 4 png Figure 4. Cellular
replication cycle in coronaviruses. Figure 4 png |
|
DOI: 10.46683/jmvi.2020.2 |
|
|
Article in Turkish |
|
|
|
|
|
|
|
|
1Department of Medical Microbiology,
Gulhane Medical Faculty, University of Health Sciences, Ankara, Türkiye. |
|
|
|
|
|
*Corresponding author Fatih Şahiner; Assoc.Prof., Department
of Medical Microbiology, Gulhane Medical Faculty, University of Health
Sciences, Ankara, Türkiye. E-mail: fsvirol@gmail.com |
|
|
|
|
|
Received: 10.04.2020 Accepted: 28.04.2020 Published: 29.04.2020 |
|
|
Cite as: Hoşbul
T, Şahiner F. Genomic and Biologic Characteristics of SARS-CoV-2 and Other
Coronaviruses. J Mol Virol Immunol 2020; 1(1): 18-29. |
|
|
|
|
|
View in academic indexes and databases |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Cited by 6 articles*, 1 book chapter. |
|
|
[1]*
Şahiner F. Analysis of a News Article in the SARS-CoV-2 Pandemic and
Infodemic with Current Scientific Literature. J Mol Virol Immunol 2020; 1(2):
54-67. doi: 10.46683/jmvi.2020.13 |
|
|
[2]*
Güven A, Diken Allahverdi T, Güven ÖD. Coronavirus: A Biochemical
Approach. Sinop Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi
2021; 6(1), 66-77. doi: 10.33484/sinopfbd.776394 |
|
|
[3]* Tahtabasi M, Hosbul T, Karaman
E, Akin Y, Konukoglu O,
Sahiner F. Does COVID-19 cause
an increase in spleen dimensions? Possible effects of immune activation, hematopoietic suppression and microthrombosis. Clin Imaging 2021; 79:
104-9. doi: 10.1016/j.clinimag.2021.04.035 PubMed:
33932872 |
|
|
[4] Hosbul T, Sahiner F. Viruses
and the importance of virus detection (Chapter 1). In: Denizli A, Saylan Y
(eds), Biosensors for Virus Detection (1st edition). 2021, IOP Publishing,
Bristol, UK. pp:1-17. doi: 10.1088/978-0-7503-3867-7ch1 |
|
|
[5]* Karakuş H.
Innate Immune Response and Immune Evasion in Viral Infections. J Mol Virol
Immunol 2022; 3(1): 1-19. doi: 10.46683/jmvi.2022.44 |
|
|
[6]* Güner Ö. Global
Surveillance Networks and International Health Regulations in the Early
Detection and Control of Epidemics. Life Med Sci 2022; 1(2): 69-78. doi: 10.54584/lms.2022.12 |
|
|
[7]* Shriwas HK, Tiwari SS. Virus and its
Identification in Modern Era. IJTSRD 2022; 6(7): 450-456. http://www.ijtsrd.com/papers/ijtsrd52363.pdf |
|
|
©Copyright
JMVI. Licensed by Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0
International (CC BY-NC 4.0). |
|
